大谷大学蔵本は、 恵空による写伝本であり上下二巻から成る。 本巻の表紙左上に 「法花問答 上」、 下巻の表紙左上に 「法花問答 下」 との題箋がある。 また、 上巻巻尾には 「ある本には決智抄の下巻を以てこの本の中巻として法花問答三巻とせり 云々」 と記されている。 体裁は半葉六行、 上巻は一行二十四字内外、 下巻は一行二十二字内外である。